Општина Боговиње функционира преку специјализирани сектори за да обезбеди ефикасни јавни услуги и транспарентно управување.
Организациска поставеност
- Градоначалник – раководител на Општината
- Секретар – општинска администрација
Општински сектори
- Сектор за правни и општи работи, урбанистичко планирање, заштита на животната средина и комунални дејности
Правно-нормативни работи, општа администрација, урбанизам, издавање дозволи и заштита на животната средина. - Сектор за јавни дејности и локален економски развој
Образование, култура, спорт, социјална заштита и локален економски развој. - Сектор за финансиски прашања
Буџет, сметководство, плаќања, администрирање на даноци и такси.